Vejen er opkaldt efter Frederiksgård, der lå omtrent hvor A. F. Beyers vej ligger i dag.
I slutningen af 1880’erne udstykkedes gårdens jord efterhånden til villagrunde.
Frederiksgårds Allé blev anlagt i 1920’erne, men kvarteret var planlagt mindst 10 år tidligere. På kortet herover ses det skitserede vejforløb, mens det endelige er på kortet herunder fra 1929.