Vejen er opkaldt efter kong Frederik den 6. (1768-1839), der i perioder boede på Frederiksberg Slot og gerne gik ture i Frederiksberg Have.
Frederik VI’s Allé fik sit navn i 1905.
Ejendommene på Frederik VI’s Allé er opført omkring 1905 og tegnet af arkitekten Eugen Jørgensen (1858-1910)
