Pladsen har eksisteret lige så længe som Frederiksberg Allé, og er bl.a. blevet kaldt “Den lille runddel” (i modsætning til Frederiksberg Runddel).
Pladsen blev først officielt navngivet i 2003. Navnet er dog langt ældre, for det henviser til landstedet Sankt Thomas, som lå her.
Apoteker A. H. Riise (1810-1882) købte i 1872 ejendommen, og da han tidligere havde drevet et apotek på den vestindiske ø Sankt Thomas, navngav han landstedet efter den.
Riise ligger begravet på Solbjerg Kirkegård.
Omkring 1905 opførtes hvor landstedet havde ligget en pompøs ejendom efter tegning af arkitekten Phillip Smidth (1855-1938).
Bygningen overtog navnet Sankt Thomas.
Samtidig anlagdes Sankt Thomas Allé, som dels går fra pladsen mod nord til Gammel Kongevej, dels fører gennem en kolonade med søjler gennem hovedbygningen til gården, der rummer andre af kompleksets fløje.
Dette arrangement blev lavet, for at undgå en baghusbebyggelse på den ret store grund.
Ved Frederiksberg Kommunes 75 års jubilæum i 1932, blev der på pladsen rejst to monumenter, udført af arkitekten Aage Sigurd Kjeldgaard Lauritzen.
De illustrerer kapitler af kommunens historie. Figurene på søjlen forestiller en falkonér og (herover) en kone fra det hollandske samfund på Frederiksberg i 1600-tallet.
Figurerne er udført af billedhuggeren Jenö Meister.
Ved Sankt Thomas Plads overtog Frelsens Hærs i 1896 en bygning, der blev indrettet som tempel og til kontor for hæren.
Bygningen er senere ombygget.