Navnet henviser til et hospital for spedalske, der lå her i middelalderen. Det var indviet til Sankt Jørgen der var de spedalskes helgen.
Hospitalet har også givet navn til Sankt Jørgens Sø.
Sankt Jørgens Allé blev anlagt i 1880’erne som en passage mellem Vesterbrogade og Gammel Kongevej.
Her blev omkring 1860 opført nogle ejendomme, som blev brugt til pensionater, hvor der bl.a. boede en del artister.
Husene blev bygget af entreprenør Andreas Hjorth Petersen, og den unavngivne vej fik navnet Petersens Passage. Først i 1899 fik vejen sit nuværende navn.
